Война заставила если не объединится, то на время забыть о различиях в политических взглядах большинство афганских лидеров. Отряды моджахедов, исповедующие различные взгляды, очень часто вели совместные боевые действия. В то же время попытки организации военно-политической коалиции в масштабах всего Афганистана неизменно терпели крах. Наибольшую известность получили следующие командиры партизан:

Ахмад Шах Масуд по национальности - таджик, бывший студент политехнического института. Самой известной базой моджахедов в Афганистане стала Пандшерская долина, где Масуд сумел отразить восемь наступлений советских войск. Перемирие, которое Масуд заключили с советскими войсками в 1983-84 г.г. - весьма сомнительно, тем не менее позиции и авторитет Масуда оставались очень высокими, особенно среди населения северной и центральной части страны, говорящей на дари, В 1984 г. советские войска установили контроль над большей частью Пандшера.

Абдул Хак по национальности патанец, бывший студент. Его отряды действовали вокруг Кабула и в самой столице. На вооружении имелись ПЗРК "Стрела" и 107-мм неуправляемые ракеты китайскою производства. И ракеты, и ПЗРК широко и эффективно использовались в 1983-84 г.г.
Сайяд Джаглан по национальности хазар, бывший майор армии ДРА, сто отряды одержали несколько побед в 1979-80 гх, никогда не действовал за пределами Хазар-Джат

Забиуллах по национальности таджик, представитель движения Джамиат, бывший религиозный учитель, руководил сопротивлением в районе Мазари-Шариф, Погиб в бою в 1984 г., его сменил Мохаммед Алим.
Исмаил Хан по национальности таджик, представитель движения Джамиак бывший майор армии ДРА, Руководил отрядами в окрестностях Герата и в самом городе.

Шабиуллах по национальности патанец, представитель движения Характ. мулла. Погиб в апреле 1985 г Сильные отряды под ею руководством воевали в Кох-и-Сафи и в районах к северо-востоку от Кабула,
Кари Тади Мохаммед Шабиуллах по национальности патанец. представитель движения Характ руководил сопротивлением в районе Газни.

Джелалладин Хагани по национальности патанец, представитель движения Хезои-и-Ислами. редшиозный учитель, его отряды действовали на юге Пактии и Пактики. Мохаммед Алан Вардак Мохаммед Алан Вардак по национальности патанец, бывший министр туризма Афганистана, полевой командир отрядов провинции Вардак. Мохаммед Анвар по национальности патанец, представитель движения Джамиат. бывший студент и спортсмен, полевой командир отрядов провинций Джагдалк, Кабул, Нангархар. Абдул Рахим Вардак по национальности патанец, бывший полковник армии ДРА.